《海交史研究》创刊于1978年，1985年由不定期内部刊物转为定期公开出版的半年刊，2019年变更为季刊。期刊由国家文物局主管的全国性学术团体——中国海外交通史研究会与福建省泉州海外交通史博物馆联合主办，同时也是中国海外交通史研究会会刊。48年向海而行，《海交史研究》形成了鲜明而稳定的专业特色，刊载内容涵盖：航海造船史、港口贸易史、中外关系史、科技文化交流史、外来宗教、海外移民、海交民俗、海交文献、海洋考古、海上交通史地考证、海上丝绸之路与海洋文化等相关研究领域。

从舟楫帆樯到港口市舶，从海路贸易到人员迁徙，从宗教传播到科技文化交流，从文献考证到水下考古——《海交史研究》持续关注历史时期中国与世界之间多层次、多区域的海洋联系，努力为中国海外交通史研究提供专业化、国际化的学术交流平台。长期以来，《海交史研究》的专业化办刊实践得到学界和相关期刊评价体系的持续关注，多年连续入选CSSCI扩展版来源期刊。2014年以来入选中国人文社会科学期刊AMI综合评价（A刊）扩展期刊。